【ＤＮＡ、字与模型：异常字统计学】统计学模型

　　Stéphane Robin, Institut National 　　Agronomique Paris-Grignon 　　Fran�ois Rodolphe, French National
　　Institute of Agriculture Research
　　Sophie Schbath, Institut National de la
　　Recherche Agrononique Unité Mathématique
　　DNA, Words and Models
　　Statistics of Exceptional Words
　　2005,138pp.
　　HardcoverUSD55.00
　　ISBN 052184729x
　　
　　S.罗宾 F.鲁道夫 S.谢巴斯 著
　　大约在15年的时间里，生物学经历了巨大的变化。而这些变化中最重要的变化是DNA序列。计算生物学中一个重要的问题是鉴别短的DNA序列(它在数学上称为字)，而这些短序列都具有生物学功能。一种鉴别方法就是决定一个特定的字是否纯粹是随机的，还是由于它出现的频率或所在的位置而具有统计学意义的。
　　本书介绍了用于解决这种所谓异常字问题的数学统计学概念。从详细描述对用于序列分析原理的模型的开始，其中马尔科夫模型是重点；捕获在被分析序列上的合成信息；接下去介绍了几种统计学方法。这些方法是考虑到用来发现异常字所使用的模型。本书的后半部分利用了对细菌基因组分析所提供的大批例子来加以说明。
　　本书分为三个部分共7章。第一部分由第1~4章组成，它们给出了对马尔科夫链以及用于序列分析的最重要的马尔科夫模型的全面介绍。这是专门针对那些不熟悉基本与通用工具的读者的。第1章绪论；第2章生物序列的简单模型；第3章对马尔科夫链模型的介绍；第4章考虑异质性。本书的第二部分第5章字出现的统计学性质，该章构成了本书的核心部分，共有三节组成：第一节涉及了搜寻具有异常频率的序列的方法；第二、三节涉及了异常字的分布。这是本书中技术性最强的一章。第三部分由第6~7章组成，第6章具有意想不到频率的字；第7章具有意想不到位置的字。
　　本书的特点在于：(1)本书是对序列统计分析的介绍，阅读本书必须掌握初步的数学知识。(2)有关生物学的必要知识在本书开头的预备概念及注释部分作了介绍，同时在绪论中介绍了一个异常字的实例。该实例是建立在对生物学背景深入了解的基础上的，它为本书的主题提供了一个稳固的基础。
　　本书可供计算生物学专业的研究人员及研究生阅读参考。而对于那些面对实际工作的用户而言，它也是一本实用指南。
　　胡光华，高级软件工程师
　　(原中国科学院物理学研究所)
　　Hu Guanghua, Senior Software Engineer
　　(Former Institute of Physics,the Chinese Academy of Sciences)